分子病毒学（molecular virology）是病毒学与分子生物学相互渗透融合而形成的一门学科。它也是一门研究病毒基因组结构与功能，探寻病毒基因组复制、基因表达及其调控机制，提示病毒感染、致病的分子本质，为病毒基因工程疫苗和抗病毒药物的研制以及病毒病的诊断，预防和治疗提供理论基础及其依据的科学。