内在神经由两种神经丛组成，包括粘膜下神经丛和肌间神经丛。

内在神经中含有大量神经元(神经元数目约l0个，几乎相当于脊髓内神经元的总数)；内在神经末梢释放的递质除乙酰胆碱和去甲肾上腺素外，几乎含有所有中枢神经系统中的递质如5-羟色胺、γ-氨基丁酸和各种肽类物质；内在神经不仅有运动功能，也有感觉功能；在正常情况下，胃肠内在神经的活动受外来自主神经(交感和副交感神经)及大脑皮层的调节和控制。