巴马瑶族自治县疾病预防控制中心的前身1956-1971年为自治县卫生局的防疫股和县人民医院的防疫科.1971年正式成立为巴马瑶族自治县卫生防疫站.经自治县人民政府批准,于2005年元月31日成立巴马瑶族自治县疾病预防控制中心,成为后自治县编制局核定编制为35人,实际在职在岗人数为47人,中心领导4人(中心主任1人,中心副主任3人),其中卫生技术人员36人,其它及后勤管理人员11人.单位功能设置有中心办公室,计划免疫科,防疫科,皮防科,财务科,后勤科,检验科,卫生科,结核病防治科.主要业务为疾病预防控制,卫生检验监测等工作，实验室通过区级计量认证.