东正教自主教会是东正教最高级别的独立教会，所有自主教会均不受其他教会的管辖。东正教最早的四个自主教会位于罗马帝国的四个重要的东方城市，即君士坦丁堡、亚历山大、耶路撒冷和安提阿。后来，俄罗斯正教会也取得了与它们同等的地位。比自主教会低一级的是自治教会，它们由某一自主教会的领袖管辖。现在东正教共有15个自主教会。

东正教自主教会列表

各自主教会实际上都是平权的；然而按历史荣誉排序如下∶

君士坦丁堡正教会

亚历山大正教会

安提阿正教会

耶路撒冷正教会

俄罗斯正教会

格鲁吉亚正教会

塞尔维亚正教会

罗马尼亚正教会

保加利亚正教会

塞浦路斯正教会

埃拉多斯正教会

阿尔巴尼亚正教会

波兰正教会

捷克和斯洛伐克正教会

美国正教会