最常见为肠道及肺念珠菌病前者引起腹泻、水样或豆腐渣样便，泡沫较多等；后者表现为支气管炎，咳粘稠胶状痰，偶有血丝，可发展为肺炎，出现体温升高、咳嗽、胸痛、双肺湿哕音等。此外还可感染食管、泌尿道、脑、心脏等器官，引起食管炎、肾盂肾炎、膀胱炎或脑膜炎、脑脓肿和心脏念珠菌病(心内膜炎)等，由这些病变的血行播散可引起念珠菌败血症乃至死亡。