生物杀线虫剂是利用生物源制剂来防治对农作物有害的线虫的农药的总称。根据其来源不同，可以分为两大类。一类为活孢子制剂，如厚垣轮枝菌活孢子制剂、淡紫拟青霉活孢子制剂；一类为生物代谢产物，如阿维菌素制剂。

此外，有研究发现，粗皮侧耳的菌丝体及代谢物对线虫也有一定的防治效果。