侵华日军南京大屠杀遇难同胞纪念馆在1983-1985年筹建之际，即成立了南京大屠杀史编辑研究办公室，之后，在社会各方面大力支持下，于1995年8月14日成立了侵华日军南京大屠杀史研究会，该会系由南京社会各方面的历史专家学者组成。2000年8月14日，该会召开了第二次会员代表大会，产生了新一届学会会长、秘书长、理事。