巨野县气象局自1957年1月1日开始开展气象工作，随着业务现代化的进一步发展，经山东省气象局批准，于2007年1月1日搬迁，工作条件及办公环境有了翻天覆地的变化，按照“四个一流”的要求进行建设。现有在职人员10人，下设：业务科、气象科技服务中心、防雷所、人工影响天气办公室（挂靠县政府）；属于国家一般气象站。