高栏出入境边防检查站的前身为1996年10月1日成立中华人民共和国高栏边防检查站，隶属于广东省边防总队，正团级；1998年7月1日变更为中华人民共和国高栏出入境边防检查站，隶属于珠海出入境边防检查总站，正处级。高栏站所属口岸为珠海港口岸，位于珠海市高栏港经济区（前身为临港工业区高栏港），所处地理位置，东经113度05分至113度17分，北纬21度50分至22度。港口以国际货运为主、其中化工危险品、集装箱占港口业务的80%以上。

管辖具体码头有：

（1）一类口岸：高栏港国际货柜码头、新海能源液化石油气码头、碧辟液化石油气码头、一德液化石油气码头、华南联合油码头、恒基达鑫化工仓储码头、珠海发电厂燃料码头、中化格力、粤裕丰钢铁燃料码头（中化格力和粤裕丰钢铁燃料码头正在申请对外开放，待验收），共9个码头；两个对外锚地，为一号锚地和二号锚地。

（2）二类口岸：平沙码头(1996经省政府批准设立的平沙二类口岸，处于平沙镇内，1996年后，因种种原因，长期废弃，码头已封闭，目前为海关监管区，2005年，当地政府申请临时成立了珠海平沙镇铎洋游艇码头，按照属地管辖原则，珠海总站将其列入该站管辖范围）。