词条 | GenBank |
释义 | § 简介 GenBank是美国国立卫生研究院维护的基因序列数据库,汇集并注释了所有公开的核酸序列。GenBank由位于马里兰州Bethesda的美国国立卫生研究院下属国立生物技术信息中心建立,与日本DNA数据库(DNA Data Bank of Japan ,DDBJ)以及欧洲生物信息研究所的欧洲分子生物学实验室核苷酸数据库( European Molecular Biology Laboratory, EMBL) 一起,都是国际核苷酸序列数据库合作的成员。 GenBank序列数据库是一个开放存取的数据库,是所有已被公开的序列的集合,由美国国立生物技术信息中心维护。GenBank和其合作者收到世界各地实验室中测得的10多万不同的生物序列。 GenBank内的数据量现仍然以指数级的速度增长,平均每18个月翻一番。GenBank即接受个别实验室的资源,也接受来自大规模测序中心散装意见。 检索方式: 如果在文献中看到过你感兴趣的基因,而且文中还提到了该基因在Genbank中的ID号,进入NCBI ,在Search后的下拉框中选择Nucleotide,把Genbank ID号输入GO前面的文本框中,点“GO”,即可以检索到所需序列。 用户可以通过NCBI(National Center for Biotechnology Information美国国家生物技术信息中心信息中心,隶属于NLM-美国国家医学图书馆)的主页使用GenBank。GenBank的宗旨是鼓励科研团体对DNA序列的获取,从而促进数据库中DNA序列的丰富和更新,所以NCBI对GenBank的数据使用与发送没有任何限制。用户可从GenBank主页上下载Banklt(NCBI提供的WWW格式,用于便捷的提交DNA序列的数据)、Sequin(NCBI的独立于操作系统的提交软件,可用于MAC、PC和UNIX平台,也可以通过FTP远程获取)以及VecScreen(带菌污染物的筛选工具)等便于提交和更新研究成果的应用软件。其页面上的简单检索界面提供19种相关检索选项,分别是:PubMed、Protein(蛋白质)、Nucleotide(核苷)、Structure(结构)、Genome(基因组)、PMC、LocusLink、PopSet、OMIM、Taxonomy(分类学)、Books(图书)、ProbeSet、3D Domains(三维区域)、UniSTS、Domains、SNP、Journals(期刊)、UniGene、NCBI Web Site(NCBI站点)。 § 相关条目 人类基因 |
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