新疆生地所辖有1个标本馆、7个野外站和若干研究基地，成为实施科普工作的重要资源，该所依托标本馆，建立了“干旱区资源与环境”科普科普教育基地，其中包括新疆资源与环境、生态动物标本、植物标本、土壤标本等展室，为实施生态科普创造了良好条件。该基地每年接待观众近万人，80%以上为中心小学生，还接待许多社会观众，包括国外人士、省部领导等，并被自治区党委组织部定为干部轮训固定教育点，在宣传新疆、提高公众生态意识方面发挥了重要作用，该基地先后被命名为国家、自治区、乌鲁木齐三级科普教育基地。野外站中的吐鲁番沙漠研究站所属的沙漠植物园，是我国植物园体系中的一个特色园，也是新疆生地所实施生物多样性和植物学科普的一个重要阵地。该园同时又是吐鲁番地区的一处旅游名胜，为传播相关科普常识创造了良好条件，每年接待游客、观众过万人，也被命名为自治区、地市两级科普教育基地，并同时在申报国家基地称号。其他的野外站和科研基地则按照自身特色，相应在所在地开展了相关的科普工作。

2002年11月9日，中国科学院新疆生态与地理研究所的标本馆和吐鲁番沙漠植物园同时被命名为新疆首批“青少年科技教育基地”，这是该所在科普工作上拥有的第6和第7个称号，也是该所在科普工作中坚持“打生态牌、创科普业、走创新路”所取得的新成就。