齐云山国家级自然保护区位于崇义县思顺乡境内，地处南岭山系与罗霄山脉交汇区的诸广山，总面积17105公顷，森林覆盖率高达97.6%，保存有南岭山地区原生性南亚热带与中亚热带过渡的常绿阔叶林森林生态系统，是我国生物多样性保护的关键地区。科学考察表明，齐云山自然保护区生物种类繁多，保存了较完好的自然生态系统，孕育了独特的生物群落，成为野生动植物理想的生长繁衍场所。保护区内已查明高等植物2843种，其中属国家Ⅰ级重点保护植物3种，Ⅱ级重点保护植物14种, 兰科植物74种；国家珍贵树种一级4种，二级10种；列入《濒危野生动植物种国际贸易公约》（CITES）附录名单36种。特别是这些稀有植物分布广，天然种群数量多。如长苞铁杉分布面积608.5 hm2, 27.67万株，最大胸径达82cm，且自然更新良好；伯乐树8000株；福建柏75.25万株。裸蒴苔、厚角鞭苔、小叶鞭苔等25种苔类和大曲柄藓、粗叶青毛藓、长叶青毛藓等19种藓类为江西新记录种，而且锦叶藓属、疣胞藓属和腐木藓属为江西新记录属，蕨类1新种，假木荷属1新种。其中蕨类植物中的缩羽毛蕨、崇义肋毛蕨的模式标本就是产自该地区。已查明的脊椎动物34目101科394种，其中属国家重点保护野生动物有50种，属国家Ⅰ级重点保护的有4种，如豹、云豹、黄腹角雉、白颈长尾雉等；属国家Ⅱ级重点保护有46种。已查明保护区内鱼类有20种；鸟类257种；昆虫1168种；陆生贝类37种；蜘蛛171种，有9种蜘蛛是世界新种；大型真菌182种。齐云山保护区地理环境独特，最高峰齐云山（海拔2061.3m）与正北面江西遂川南风面（2120m）和正西面湖南八面山（2040m）三座高山之间有一条46km宽的凹形通道经过齐云山自然保护区，是我国中部候鸟迁徙的重要通道之一。