海门市审批服务中心成立于2001年10月，有23个市直部门和5个条管部门进驻中心设立办事窗口。2003年，中心管理机构正式定编为正科级建制，为政府派出机构。

中心成立以来，始终坚持“服务经济，方便群众”的宗旨，以提高服务能力，优化投资环境为出发点，努力打造全国一流、全省最佳的服务平台和办事平台，各项工作取得了显著的成绩。中心年受理各类办件13万多件，办结率达98%，年收费额达3亿多元。中心连年被评为“南通市文明单位”、“海门市五星窗口”、“海门市十佳文明窗口”，有多个窗口连年被评为“南通市青年文明号”、“海门市青年文明号”和“江苏省用户满意服务明星班组”。近年来，中心不断加强规范化管理，推出了制度化、人性化、民主化的“三化”管理模式，探索最简化的审批流程，创立了以一大规程、两级代理、三制式审批、九大提速项目审批制度为内容的“海门模式”；全省首创生产性项目统收统分收费办法和项目竣工联合验收模式，中心专门设立窗口负责统一收取费用，统收统分实施后，办理项目交费从原来的26次减少到3次，极大地方便了群众，提高了审批效率。2005年中心高质量通过ISO9000质量体系认证，成为江苏省首家通过认证的行政审批中心。