根据《中共中央办公厅、国务院办公厅关于印发〈上海市人民政府机构改革方案〉的通知》（厅字〔2008〕17号）的规定，设立上海市水务局，为市政府组成部门。上海市海洋局与上海市水务局合署办公。

主要职责

内设机构

主要职责

（一）贯彻执行有关水务、海洋管理的法律、法规、规章和方针、政策；研究起草有关水务、海洋管理的地方性法规、规章草案和政策，并组织实施。

（二）根据本市国民经济和社会发展总体规划，负责编制本市水务、海洋专业规划、中长期发展规划和年度计划，并组织实施；会同有关部门，制定本市水功能区划、海洋功能区划；参与制定流域防洪、水资源和海区海洋经济、资源、环境等规划。

（三）负责本市水资源（地表水、地下水）的统一管理和保护；负责制定水资源中长期供求计划、水量分配和调度方案并监督实施；组织实施取水许可制度、排水许可制度和水资源费征收工作；核定水域纳污能力，提出限制排污总量建议；负责计划用水工作、节约用水工作。

（四）会同市有关部门，管理滩涂资源，组织编制滩涂开发利用和保护的规划、年度计划并监督实施；负责本市长江河道的采砂管理。

（五）主管防汛抗旱工作，承担市防汛指挥部的日常工作。

（六）主管本市水文工作，组织实施水文水资源监测、水文站网建设和管理，发布水文水资源信息、水文情报预报和水资源公报。

（七）负责水利、供水、排水行业的管理，并承担相应的监管责任；研究提出有关水务的价格、财务等经济调节意见，参与对水务、海洋管理资金使用的管理。

（八）主管本市河道、湖泊、江海堤防，负责本市水务工程建设和管理；组织、指导和监督水务工程设施的建设和运行管理；负责本市水务建设工程质量和安全监督管理；负责实施具有控制性的或跨区域的重要水利工程的建设和运行管理。

（九）负责农村水利工作，组织、指导农田水利基本建设；会同市有关部门，组织实施水土保持工作。

（十）负责本市海域海岛的监督管理；审核海域使用申请，实施海域权属管理和海域有偿使用制度；负责海底电缆、管道审批和监督管理；负责本市海域勘界、海洋基础数据管理；负责综合协调海洋事务。

（十一）承担保护海洋环境的责任，组织海洋环境调查、监测、监视和评价；会同有关部门，制定地方海洋环境保护与整治规划、标准、规范，执行国家确定的污染物排海标准和总量控制制度；负责防治海洋工程项目和海洋倾废对海洋污染损害的环境保护工作；核准海洋工程环境影响报告书，提出海岸工程环境影响报告书的审核意见；监督管理海洋自然保护区，负责海洋生态环境保护；负责海洋环境观测预报和海洋灾害预报警报。

（十二）依法实施水行政执法和海洋行政执法，查处违法行为；协调部门间和区县间的水事纠纷，负责协调水务、海洋突发事件的应急处理；监督管理涉外海洋科学调查研究、海洋设施建造、海底工程和其他海洋开发活动。

（十三）研究制定水务和海洋发展的重大技术进步措施，组织海洋基础与综合调查和水务、海洋重大技术攻关；组织实施国家有关水务、海洋技术质量标准和规程、规范，承担地方标准的起草。

（十四）承担有关行政复议受理和行政诉讼应诉工作。

（十五）承办市政府交办的其他事项。

内设机构

（一）办公室

（二）政策法规处

（三）综合规划处

（四）计划财务处

（五）建设管理处（农村水利处）

（六）水资源处（市节约用水办公室）

（七）滩涂海塘处

（八）海域海岛管理处

（九）海洋环境保护处

（十）防汛和安全监督处

（十一）科技信息处

（十二）水土保持处

（十三）组织人事处