根瘤菌到达皮层内部后，根瘤菌利用根细胞的营养大量繁殖，并在突起中形成许多特殊结构-泡囊，每个泡囊含6-8个根瘤菌。

1896年Janse首先命名了“泡囊”，由一种内生菌根真菌在植物细胞内产生，并同时产生“丛枝”，这一真菌与植物之间形成互惠共生关系，称为“泡囊-丛枝菌根（VAM）”。