中美联合海洋生态动力学开放实验室研究区域定于：1）渤海；2）胶州湾；3）黄海；4）东海；5）南海的北部湾和大亚湾。研究侧重于物理和生物、化学过程非线性的耦合作用，以及对中国沿岸生态系的影响。当基础研究达到一定水平后，实验室的研究重点将转移到整个东中国海和南中国海，并将发展一个具有预报能力的中国沿海海洋生态动力学模型。本实验室设置海洋生态学和物理海洋学两个学科。拥有包括变水层拖体、CTD、OPC、APS在内的走航连续观测系统1套，可以完成现场水文、浮游植物、浮游动物等多项参数的同步连续观测；室内拥有库尔特全自动颗粒分析仪、OPC全自动分析仪、PC工作站等一系列先进的仪器设备。目前该实验室承担国家973项目课题4项，国家杰出青年基金1项、国家自然科学基金3项、中国科学院“百人”计划基金1项、中国科学院创新项目课题1项。实验室的目标是通过中美合作，共同进行海洋生态动力学的研究，发展适用于中国海的海洋生态动力学模型，同时建立起中美海洋学家合作和学术交流的桥梁，联合培养研究生，提供国内外大学和研究所开放合作的研究基地，促进海外学者回国为中国海洋事业服务。总而之言，建立实验室的最终目的是：促进中国海洋生态动力学的发展，以及下个世纪赶超世界先进水平。