此建筑物为世界著名建筑家——黑川纪章的遗作。建造处可瞭望日本国家指定特别史迹“原之辻遗迹”。此设计的一大特点是完全融合与弥生时代相似的原始风景的群山之中。位于馆顶的展望室高80米，可以360度眺望“原之辻遗迹”。馆内以“以海洋为媒体的历史交流与贸易”为主题，利用年表和实际数据资料来比较介绍东亚及日本和壹岐的历史。可触摸到从周围的遗迹中挖掘出土的文物及使用最新技术和独特展示手法来展示主题，是一间令人有耳目一新感觉的博物馆。