毛豆锈病主要危害叶片。被害叶片密生针头大的小锈斑，病菌埋生于寄主表皮下未成熟的夏孢子堆，随着夏孢子堆的发育，表皮破裂散出锈色粉状物(夏孢子团)。后期叶片出现黑色小点，为病菌的冬孢子堆。
1、选用抗病高产良种，用新高脂膜进行拌种处理（能有效隔离病毒感染，不影响萌发吸胀功能，加强呼吸强度，提高种子发芽率和出苗率）。适期播种，合理密植。
2、保证水肥平衡，避免植株徒长和土壤过湿，可减轻发病。在花蕾期、幼荚期和膨果期各喷一次菜果壮蒂灵，可强花强蒂，增强授粉质量，促进果实发育，无空壳、无秕粒，使作物连连丰产。
3、做好病情监测，发病初期要按植保要求用针对性药剂加新高脂膜进行防治。