“时轮”一词既是本尊佛名，又是时轮理法的名称。“时轮”是指宇宙和生命在时间中的生灭规律和与此相应的修炼方法以及终极目的。

时轮又分为外轮、内轮、别轮。

“外轮”指的是天地时间周期，以年为“时”，日行12宫，时行21600时分为“轮”(时轮历，一昼夜平均为60时分，360日×60 = 21600)，周而复始，流转不息，形成四季的交替，万物的生灭。

“内轮”指的是人体的气脉循环周期，以一昼夜为“时”，诸气遍行12轮，呼吸21600次为“轮”(平均一次呼吸等于现行时制的4秒种)，流动循环形成人体的新陈代谢和生死交替。

“别轮”指的是一种根据内外时轮客观规律所采取的以改变世间生死规律、净化超脱为目的的修持方法和终极目标——即时轮道路和时轮佛位。

时轮佛的形象是佛祖释迦牟尼在说时轮法时所化现的威严像，也是时轮密法义理的象征。时轮主佛的身色形态、所执法器，以及坛城和坛城中种类繁多的主从佛众都和内外“时轮”的事相有着相应相对的关系，展示着天道、人道和佛道之间神秘莫测的内在联系。