九龙殿又称圆通殿，为法雨寺的主殿。殿前有古树十余株，其中两棵大树（古银杏、古桧柏）高入云天——西侧的银杏粗约三抱，树龄在500年以上；东侧的龙凤柏苍老劲健、蟠屈如虬螭，形状独特，是普陀山最有名的两株古柏。

大殿台前三面石栏板上分刻着二十四行孝图，取自元代郭居敬编撰的古今二十四孝子的故事（孝悌本是儒学内容，但在许多佛家寺庙也有所描述）。这些浮雕构图完整，线条流畅，是明代石刻浮雕中的精品，有很高的艺术价值。

大殿是清康熙三十八年(1699年)康熙皇帝赐“法雨禅寺”额时，下发“拆金陵旧殿以赐”令，拆金陵城内琉璃瓦12万张，仿金陵明故宫九龙殿盖成。殿分7间，高22米，面阔35.35米，进深20.31米，面积近1000平方米。

大殿内无一梁、一钉，堪称一绝，是目前国内寺院建筑中规格最大、建筑艺术水平最高的佛殿。

九龙殿内最有名的当数普陀三宝之一的“九龙藻井”：藻井按古朴典雅的九龙戏珠图案雕刻而成，一条龙盘顶，八条龙环八根垂柱昂首飞舞而下。

八根金柱的柱基是精致的雕龙砖，正中悬吊一盏琉璃灯，宛若一颗明珠，组成九龙戏珠的立体图案，造型优美，刀法粗犷，成于明初，九龙殿之明名便因此而得。