指在结构、功能乃至发生上相互关联、由膜包被的细胞器或细胞结构，主要包括内质网、高尔基体、溶酶体、胞内体和分泌泡等。

细胞内区室化是真核细胞结构和功能的基本特征之一。细胞内被膜区分为3类结构：细胞质基质、细胞内膜系统和其他由膜包被的各种细胞器（如线粒体、叶绿体、过氧化物酶体和细胞核）。