生理始基即某些心身疾病病人发病前的生理特点，它决定个体对疾病及种类的易患性。研究发现，一些重大灾难过后，仅少数人患心身疾病，而且所患疾病也各不相同，其原因除了个体的人格特征和行为方式，主要取决于病人原有生理特点的差异。故心身疾病的生理始基和社会心理因素刺激共同作用的结果，如研究发现，高甘油三酯血症是冠心病的生理始基，高尿酸血症是痛风症的生理始基，高蛋白结合碘是甲状腺功能亢进的生理始基。