上海动物园两栖爬行动物馆室内面积3180平方米，部分为二层建筑，室外面积200平方米，于1994年建成开放。主要由序言厅、水族厅、两栖动物厅、蜥蜴厅、无毒蛇厅、毒蛇厅和生态厅七部分组成。

水族厅展出海洋珊瑚鱼类、热带观赏鱼类和淡水经济鱼类，包括中国特产的保护鱼类中华鲟、胭脂鱼，以及蠵龟、玳瑁、海龟等大型海产爬行动物。

两栖厅有中国特产的大鲵（娃娃鱼）、树蛙，以及古时用于检测妇女怀孕与否的滑爪蟾等。 蜥蜴厅内的6米巨蟒、“五爪金龙”——巨蜥、陆龟等珍稀濒危野生动物。 蛇类厅也有网纹蟒、各种有毒和无毒蛇。 生态厅模拟亚热带动物生态环境，种植了几十种热带植物。游客可以俯视饲养在其中的中国特产扬子鳄、长3米多的湾鳄、超过10公斤的马来西亚巨龟，曾经还展出过斑鳖。