商洛市疾病预防控制中心是2003年9月在原市卫生防疫站基础上组建起来的一个具有社会公益性质的公立卫生事业机构。其职责是依法履行全市疾病预防和突发公共卫生事件应急处理工作的业务培训与技术督导，检验监测与卫生评价，科学研究与技术服务，健康教育与健康促进。主要承担全市重大传染病、地方病、寄生虫病、慢性非传染性疾病、职业病、公害病和群体性及不明原因疾病的现场调查研究与预防控制；负责全市预防性生物制品管理，组织实施预防接种工作；开展疾病防治知识宣传和健康咨询；开展常见病原微生物检测和常见毒物、污染物的检验鉴定；开展食品卫生、职业卫生、放射卫生和环境卫生等领域健康危害因素监测，管理全市疫情及相关公共卫生信息；负责全市疾病控制机构业务指导、人员培训和业务考核，指导全市医疗卫生机构传染病防治工作。

中心内设综合科、总务科、技术质量管理科、流行病科、结核病防治科、艾滋病防治科、地方病防治科、免疫规划科、健康教育与健康促进科、卫生检验科、卫生科、综合门诊部、结核病防治门诊等13个科室。中心人员编制54人，现有人员62人（外聘8人），各类专业技术人员54人，其中高级专业技术人员6人，中级技术人员34人。

近年来，中心在市委、市政府和市卫生局的正确领导下，在省卫生厅及省上有关业务部门的大力支持与精心指导下，先后完成了丹凤特大氰化钠泄露事件、全市艾滋病目标人群调查、矿山民工群体性尘肺病诊断调查、丹凤峦庄鼠药中毒以及多次救灾防病等公共卫生突发事件的应急处理工作，为商洛经济建设和群众身体健康做出了贡献，多次受到卫生部、省、市委政府的表彰奖励。