假定基因,顾名思义，也就是假定之中的基因。生物的基因组中的序列的功能并不都为人所知，他们编码的蛋白的功能人们也并不了解只是出于一种推测之中，比如Sorghum bicolor hypothetical protein 这是一种假像蛋白，而Populus trichocarpa predicted protein是一种预测蛋白，诸如此类的都是假定蛋白也就是没有实际功能或者功能没有被证实的，而编码他们的基因就是假定基因。