二期结构（second texture）又称次生岩浆结构。在主体期结构花岗岩形成之后，残余岩浆的结晶物质下沉，可能伴随着熔融体和挥发分向上运动而造成的花岗岩结构。同时在早期（即主体期结构花岗岩形成阶段），岩浆温度比较高，水的含量比较低，早期固结作用之后无水或几乎无水矿物结晶，使残余岩浆熔融体中水含量增加。当熔融体水饱和时，就会形成一种富含水分的流体相，进一步结晶作用会使这种流体相的体积增加，结果引起补充期结构花岗岩的侵入、挥发分的丢失以及压力的骤减。补充期结构花岗岩出现两种演化序列：①细（微）粒巨斑状→细（微）粒斑状→细（微）粒少斑或等粒演化序列；②细粒斑状→微粒斑状演化序列。