位于平谷县西北部。东北邻北店，南临前吉山。因此村坐落在丫髻山下，故名。

远在新石器时期，此村域就有人类活动。唐代建房舍，明代形成相当规模的村落，称纸坊庄。后因丫髻山庙会兴盛，远近闻名，改称丫髻山。抗日战争时期，以村中石桥为界，分为两个行政村，此村位于桥北，演化为今名。吉即“髻”的谐音。

丫髻山因其两座山头耸，像古代女童头上的两发丫髻而得名。自唐初便有道士在此结庐修炼。唐贞观六年（632），建殿堂于西顶。元代改为碧霞元君祠。明嘉靖年间，河北香河一王姓老媪，人称王二奶奶，来此募化修庙，建成铁瓦店。明世宗朱厚熜敕赐“护国天仙宫”门额。据《昌平山水记》载：“天启七年（1627）巡按御史倪文焕请建太监魏忠贤生祠于此，赐名崇功祠未成而忠贤败。”唐熙三十七年（1698），重修元君祠，康熙赐“敷锡广生”匾额。康熙四十三年（1704），康熙初游丫髻山。康熙五十二年（1713），丫髻山主持李居祥为祝康熙六十大寿。于丫髻山东顶建玉皇阁。康熙题匾额“清虚真宰”赐玉皇阁。康熙五十三年（1714），建成丫髻山行宫。康熙五十四年（1715），康熙作《玉皇阁碑文》称丫髻山为“近畿福也”。乾隆皇帝也曾两游丫髻山。据传，乾隆为还小时出家之愿，曾派替身来此出家，并按丫髻山道教派谱系取道名为“乾一丙”。雍正元年（1723）后，每年由内条府于农历四月十八日到“丫髻山进香成为定制。道光十六年（1836），重修碧霞元君祠，翌年，道光与皇太后同游丫髻册。丫髻山几乎成了清朝皇室的家庙。

抗日战争和解放战争时期，丫髻山庙毁于炮火。1986年，平谷县政府恢复了每年农历四月的丫髻山庙会。由当地村民集资和游人捐款，逐年修复了碧霞元君祠 等建筑。每年四月庙会期间，丫髻山又重现了当年在盛况，游人达百余万人次。