阿拉塔格组（Alatag Fm）的时代属中泥盆世早期。在新疆托克逊县喀拉克孜勒山东侧剖面以灰、灰黑色生物灰岩、大理岩为主，夹绢云绿泥石英片岩、变质砂岩和砂砾岩，底部为灰色砾状灰岩、白色砾状大理岩，与下伏阿尔皮什麦布拉克组和上覆萨阿尔明组均呈整合接触，厚6167米，灰岩中含珊瑚Favosites、Pachyfavosites、Heliolites、Emmonsia、Xystriphyllum等。在克孜勒塔格以北山区，由结晶灰岩、砂岩、粉砂岩、绿泥绢云石英片岩组成，含珊瑚Thamnopora incerta、T ex gr tumefacta、Heliolites、Squameofavosites和Pseudamplexus，厚2100～4000米。在喀拉塔格南坡由深灰色碎屑灰岩、鲕状灰岩、砂岩、硅质岩夹砾岩组成，含珊瑚Thamnopora cf reticulata、Wedekindophyllum cf corneolum等，出露厚度181米。在开都河以南，赛日木河以北，为硬砂岩夹粉砂岩、砾岩，上部为灰岩、白云岩夹钙质砂岩，含珊瑚Disphyllum、,Cyathophyllum、Favosites及腕足类Camarotoechia,Atrypa等，厚3217米。在萨阿尔明山以南，柳树沟—伙浪窝特一带夹有基性—中酸性火山岩、火山碎屑岩，总厚度达5974.6米。