综合账户差额是指经常账户和资本与金融账户中的资本转移、直接投资、其他投资账户所构成的余额，也就是将国际收支账户中官方储备账户剔除后的余额（如果考虑基本账户差额的话，综合账户差额可以理解为基本账户差额加上了短期资本流动）。

综合账户的意义在于可以衡量国际收支对一国储备持有所造成的压力，因为综合账户差额必然导致官方储备的相反方向变动。