中山大学在八十多年的历史中，曾经使用过几种形式的校徽。现在的校徽于八十年校庆后开始使用，由该校艺术教育中心教师姚友毅先生设计。

校徽为圆形图案，校徽上部自左而右环绕中文校名标准全称，下部自左而右环绕英文校名标准全称，中间为海棠式洞窗图案。洞窗图案以国立广东大学的标志性建筑“大钟楼”为设计主体，运用中国园林的意境与现代的设计手法，借用园林中的海棠式洞窗与大钟楼外观组合成“中山”二字，洞窗内两边的树由大到小形成一个深远的空间，增强了层次感和立体感，中间的弧形巧妙形成一朵红棉花，是岭南地区标志性树种，意寓中山大学扎根于岭南地区。由建校年份“1924”形成的一条纵深大道，体现了中山大学深厚的学术积淀和辉煌的历史进程。

中山大学校徽通常为标准绿色，代表生命、发展、永恒，象征着中山大学充满活泼、盎然的生机。

校徽庄重大方，具有强烈的张力。其内聚性、外拓性、向上放射性凝聚了中山先生提倡的"博学、审问、明辩、慎思、笃行"的治学精神，也体现了中山大学全体师生团结奋斗的精神和强烈的荣誉感、归属感和自豪感。

中山大学校徽是学校视觉识别系统的核心要素，使用权限以及大小、颜色等遵循《中山大学视觉识别系统》相关规程。在实际使用时可以根据实际情况衍生数种变体和组合方式，颜色亦有黑色等其他配色可供选择。