中国疾病预防控制中心麻风病控制中心（以下简称“麻风中心”）座落在江苏省南京市紫金山北麓，前身为1954年在北京成立的“中央皮肤性病研究所”（即现在的“中国医学科学院中国协和医科大学皮肤病医院（研究所）”，以下简称“医科院皮研所”），直属卫生部领导，重点承担指导全国性病防治任务。当时全国尚无全国性机构负责麻风防治工作。1956年1月，中共中央颁布的《全国农业发展纲要（草案）》中明确了麻风病应当积极防治的任务后，“医科院皮研所”多次承担全国性的麻风防治任务。1958年“医科院皮研所”划归中国医学科学院。同年，该所成立性病、麻风病、头癣研究组。1963年5月调整成立麻风病研究室。1970年搬迁到江苏泰州。1978年，卫生部科委制订的全国科研规划中指定“医科院皮研所”为麻风专题的全国总负责单位。1982年3月，卫生部确定“医科院皮研所”为全国麻风病防治、研究、培训和指导中心。1984年搬迁至南京，1990年，卫生部卫生防疫司在本所成立了全国麻风疫情监测总站。1994年4月，卫生部发文明确将原全国性病防治研究中心、麻风病研究室和全国麻风疫情总站等机构统一调整为全国性病麻风病控制中心，与中国医学科学院皮肤病研究所、皮肤病医院合署办公。2002年1月，原全国性病麻风病控制中心更名为中国疾病预防控制中心性病麻风病防治技术指导中心，并成为中国疾病预防控制中心的挂靠单位。2005年5月，卫生部卫人发<2005>218号文将原“中国疾病预防控制中心性病麻风病防治技术指导中心”更名为“中国疾病预防控制中心性病控制中心”和“中国疾病预防控制中心麻风病控制中心”。

“麻风中心”是由政府举办的实施国家级麻风病预防控制和与麻风病相关的公共卫生技术管理和服务的公益事业单位。其任务是通过对麻风病及其残疾和伤害的预防控制，创造健康环境，维护社会稳定，保障国家安全，促进人民健康；其宗旨是以科研为依托、以人才为根本、以防治为中心，发挥麻风病技术管理及技术服务职能，围绕国家对麻风病的疾病预防控制任务，加强对麻风病预防控制策略与措施的研究，做好麻风病预防控制工作规划的组织实施；开展麻风病的公共卫生业务管理工作，大力开展应用性科学研究，加强对全国麻风病预防控制和与麻风病相关的公共卫生服务的技术指导、培训和质量控制，在麻风病防治及其卫生信息能力的建设等方面发挥国家队的作用。