词条 | 生物信息学概论 |
释义 | 基本信息作者:(美)奎恩(Krane,D.E.),(美)雷默(Raymer,M.L.) 著,孙啸 等译 ISBN:10位[7302094306] 13位[9787302094302] 出版社:清华大学出版社 出版日期:2004-10-1 定价:¥36.00 元 内容提要本书是为不同学科背景的学生学习生物信息学而精心设计的一本入门教材,目的是使学生掌握生物信息学的基本概念和基础知识,学习生物学家或计算机科学家考虑问题和解决问题的方法。 本书介绍了生物学和计算机应用的基础知识,提出了许多生物信息学的基本问题,阐述了生物信息学的基本分析方法。此外,本书还给出了许多实用算法和例程。 本书是一本优秀的生物信息学概论或导论教材,可作为生物信息学方向高年级本科生或研究生的入门教材。 作者简介孙啸,男,教授,博士生导师,1962年生。曾经承担多个国家自然科学金项目、国家863项目以及省部科研项目,主持研制出多个软件系统。近年来发表论文40多篇。与他人合作出版专著2部,获得发明专利1项。目前在东南大学生物科学与医学工程系工作,主要从事生物信息学及基因芯片信息学研究工作。主讲过多门课程,早在1999年就开设了“生物信息学”研究生课程。在人才培养方面,致力于工医复合型人才的培养。曾经获得江苏省优秀研究生指导教师、江苏省优秀硕士学位论文指导教师称号。 目录第1章 分子生物学和生物化学 1.1 遗传物质 1.2 基因结构和遗传信息 1.3 蛋白质的结构与功能 1.4 化学键的本质 1.5 分子生物学工具 1.6 基因组信息 本章总结 阅读资料 问题 第2章 数据库搜索与两两对比 2.1 点阵图 2.2 简单比对 2.3 空位 2.4 打分矩阵 2.5 动态规划:Needleman和Wunsch算法 2.6 全局对比与局部比对 2.7 数据库搜索 2.8 多重序列比对 本章总结 阅读资料 问题 第3章 替换模式 3.1 基因内的替换模式 3.2 估算替换数目 3.3 基因间进化率的变化 3.4 分子时钟 3.5 细胞器的进化 本章总结 阅读资料 问题 第4章 基于距离的系统发生分析 4.1 分子系统发生的历史 4.2 分子系统发生分析的优点 4.3 系统发生树 4.4 距离矩阵法 4.5 最大似然法 4.6 多重序列比对 本章总结 阅读资料 问题 第5章 基于特征的系统发生分析 第6章 基因组学和基本识别 第7章 蛋白质和RNA结构预测 第8章 蛋白质组学 附录A 计算机编程和数据结构的简介 附录B 酶动力学 附录C PERL程序举例 词汇表 部分问题的答案 同名图书基本信息书名:生物信息学概论。 图书编号:1368047 出版社:第四军医大 定价:15.0 ISBN:781086023 作者:王哲 出版日期:2002-02-01 版次: 1 开本:32开 简介本书跟踪生物信息学的最新进展,介绍了这一学科的基本理论、常用生物学数据库(NCBI/、EBI和GenomeNet)的基本内容和使用方法以及生物信息学在基因级分析、蛋白南组学研究和其他繁琐哲学这领域研究中的应用。另外,附录中还列出350余条分子生物学数据库网址和内容介绍。可供从事相关专业研究人员参考,也适合于生物医学类专业本科生和研究生学习使用。 目录第一章 概论 第一节 生物信息学及其与生物学的关系 一、生物信息学的定义 二、生物学的发展与生物信息学 三、基因组学、蛋白质组学与生物信息学 四、国内生物信息学现状及展望 第二节 计算机在生物学及医学领域的应用 一、生物学、医学的计算机 二、计算机算法 三、不同类型计算机的功能 四、计算机分析的局限性 五、对更好的计算机工具的需求 六、网络与生物信息学 第二章 生物大分子 第一节 蛋白质的结构与功能 一、蛋白质的结构 1. 氨基酸的结构 2. 肽键与肽链 3. 蛋白质的构象 二、蛋白质功能 第二节 核酸的结构和功能 一、NDA和RNA的结构 二、遗传密码 三、基因与进化 第三章 数据库和搜索工具 第一节 计算机工具和数据库 一、美国国家生物技术信息中心(NCBI) 二、欧洲生物信息学研究所(EBI) 三、日本生物信息学服务器(GenomeNet) 第二节 数据库开发工具 一、序列相似性搜索工具 二、特征识别工具和数据库 第四章 基因组分析 第一节 DNA克隆和PCR 一、DNA克隆 二、转录谱 三、定点克隆 四、多聚酶链式反应(PCR) 五、发展中的测序技术 六、监测测序进展 第二节 DNA序列分析的计算机工具 第三节 基因组分析 第四节 功能基因组 第五节 人类基因组计划与生物信息学研究 第五章 蛋白质组分析 第六章 生物信息学在生物学中的其它应用 |
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