分子动力学法(MD法;Molecular Dynamics method),是用计算机模拟的一种,是调查物质诸性质时候使用的手法之一。根据在计算机中每时每刻的追踪全部的粒子的运动的规律,导出物质全体的性质这就是分子动力学法。

分子动力学法是要严格求解每个粒子的运动方程，通过分析系统来确定粒子的运动状态。MD方法一般认为粒子服从牛顿运动规律，粒子所受到的作用力通过粒子间相互作用势计算，因此粒子的初始条件和运动方程中的受力状况一旦确定，系统就可被精确求解。