分子量300以上并有极性基团的药物主要从从肝进入胆汁排泄。胆汁排泄对于因为极性太强而不能在肠内重吸收的有机阴离子和阳离子是重要的消除机制。从胆汁排泄进入小肠的药物中，某些具有脂溶性的药物可被重吸收，葡糖苷酸结合物则可被肠道微生物的β-葡糖苷酸酶所水解并释放出原形药物，然后被重吸收，这就是肝肠循环。已知已烯雌酚、消炎痛、氯霉素、红霉素、吗啡等能形成肝肠循环。