杂交是指不同基因型配子结合产生杂种的操作过程。杂交是生物遗传变异的重要来源，基因重组是杂交的遗传学基础。在遗传学研究中，有性杂交不但可以鉴定物种间的亲缘关系，而且它还是目标性状遗传分析的基础。不管是性状的显隐性分析、性状的分离规律与独立分配规律、多对相对性状杂种的遗传分析或是基因的互作分析，材料之间的相互杂交始终是目标性状遗传分析的第一步。只有在获得杂种一代（F1）的基础上，通过自交、测交等方式才能对目标性状进行详尽的遗传分析。此外，有性杂交也是种质创新的有效手段。一直以来，各国的植物育种学家都十分重视育种基础材料的创新，许多高抗（多抗）和适应性强的优良品种大多是通过有性杂交育成的，特别是利用多亲本杂交育种，综合了多个亲本的优良特性。但在实际生产中，有性杂交获得的杂种只是经过基因重组后产生的育种原始材料，即提供了综合优良性状于同一体的可能性。优良基因型能否在杂种后代出现和被保留下来，并纯化为优良品种，还取决于对杂种后代进行培育和选择的手段以及一系列的试验鉴定。