大夏河裸裂尻鱼国家级水产种质资源保护区总面积3488.2公顷，其中核心区面积1791.7公顷，实验区面积1696.5公顷。核心区特别保护期为4月至8月。保护区位于甘肃省夏河县境内的桑科乡、科才乡大夏河、科才河黄河支流河段，范围在东经102°1′15.67″-102°29′11.98″，北纬34°37′49.19″-35°10′24.47″之间。核心区大夏河水系分大夏河干流和二条支流组成，科才河水系由干流和四条支流组成。大夏河干流从大布勒赫卡（102°7′45.58″E， 35°0′12.7″N）起，到英布囊曲（102°29′31.88″E， 34°59′23.16″N），流程28km，面积为476公顷；大夏河支流第一段从然却合瓦玛曲上游（102°14′38.33″E， 34°54′51.52″N）起到大夏河干流汇入点（102°18′46.69″E， 34°57′53.65″N），流程6.1km， 面积为103.7公顷；大夏河支流第二段从英布囊曲（102°22′6.94″E，34°55′31.31″N）起到大夏河干流汇入点（102°29′31.88″E， 34°59′23.16″N），流程7.9km， 面积为134.3公顷。科才河干流从完青卡（102°6′45.99″E， 34°59′48.13″N）起，到科才乡哈西村（102°9′39.97″E，34°45′49.08″N）止，流程27.9km，面积为474.3公顷；科才河支流第一段从完欠克温曲（102°2′48.40″E， 34°53′39.25″N）起到达久塘科才干流汇入点（102°8′38.89″E， 34°50′34.65″N），流程11.1km， 面积为188.7公顷；科才河支流第二段从奥合格塘（102°3′47.19″E， 34°50′6.88″N）起到大夏河干流汇入点（102°8′38.898″E，34°50′34.65″N），流程9km， 面积为153公顷。科才河支流第三段从曼曲（102°11′44.10″E，34°52′57.38″N）起到科才干流汇入点（102°8′38.89″E，34°50′34.65″N：），流程6.2km， 面积为105.4公顷；科才河支流第四段从楠木让（102°3′58.42″E， 34°47′42.91″N）起到哈西科才河汇入点（102°9′39.97″E， 34°45′49.08″N），流程9.2km， 面积为156.4公顷。实验区主要由大夏河、科才河干流及部分支流组成。大夏河干流从英布囊曲（102°29′31.88″E， 34°59′23.16″N）起，到桑科乡与拉卡楞镇交接处（102°28′2.97″E，35°8′44.95″N），流程19km，面积为323公顷；大夏河支流第一段从多玛高恰（102°29′11.98″E，34°57′37.22″N）起到大夏河干流汇入点（102°24′28.14″E，35°5′28.90″N），流程17.9km， 面积为304.3公顷；大夏河支流第二段从多哇河（102°24′9.68″E，35°10′24.47″N）起到大夏河干流汇入点（102°28′2.97″E，35°8′44.95″N），流程6.7km， 面积为113.9公顷。科才河干流从科才乡哈西村（102°9′39.97″E， 34°45′49.08″N）起，到碌曲县交接处（102°14′47.28″E， 34°38′8.65″N）止，流程17.1km，面积为290.7公顷；科才河支流第一段从克其合曲（102°3′38.28″E，34°43′28.66″N）起，到碌曲县交接处（102°14′47.28″E，34°38′8.65″N）止，流程23.2km，面积为394.4公顷；科才河支流第二段从托日当贡玛曲（102°2′21.79″E，34°39′20.69″N）起，到尕高日（102°7′25.92″E， 34°37′49.19″N），流程9.1km，面积为154.7公顷；科才河支流第三段从托日当休玛曲（102°1′15.67″E，34°38′8.65″N）起，到尕高日（102°7′25.92″E，34°37′49.19″N），流程6.8km，面积为115.6公顷。主要保护对象为黄河裸裂尻鱼，其他保护物种包括花斑祼鲤、厚唇重唇鱼、极边扁咽齿鱼、似鲶高原鳅、小眼高原鳅、硬刺高原鳅、黑体高原鳅、壮体高原鳅、水獭、西藏山溪鲵等。