庆应义塾大学医学部创建于1917年，它的建立与福泽谕吉的影响密切有关。福泽最早在大阪的医学者绪方洪庵开办的适塾中学医，深知实学的重要，对医学产生浓厚兴趣，并积极支持开办医学。当时从德国归来的世界知名细菌学者北里柴三郎在福泽的要求下出任首届学部长。该部已培养出7,000余名毕业生，他们活跃在世界各地，在医学教育、研究、医疗保健、医务行政等方面均作出了很大贡献。位于信浓汀校区的新建大学附设医院为日本屈指可数的几个最先进医院之一，全部由计算机控制，有360个终端，1071张病床，每日就诊人数可3700多人。