该寺位于哈密市回城乡阿孜那巴扎，为哈密最古老的清真寺。据传，该寺是明弘治三年（１４９０年）由伊犁来哈密传教的贺加·莫合买提艾力修建，原寺毁于清乾隆四十年（１７７５年），后由一名叫玛依努尔帕克的妇女捐资重建。

主玛寺为土木结构，前门为一高耸之古堡型土塔，土坯垒砌，顶部四角尖耸，上为唤礼塔，底宽４米，高１２米，进前门中为礼拜堂，左右有穹窿顶屋各５间支撑屋顶，屋顶装饰方形藻井图案，天窗顶部亦有藻井图案，四面开窗。礼拜殿西有一木制的下方上园穹窿式小亭。回王时期，为大小台吉艾兰木大阿訇礼拜之处。整个主玛寺东西长３８米，南北宽２４米，建筑面积９１２平方米，墙厚１．５米。由于年久失修，土塔部分裂缝倾斜。１９８７年，由自治区宗教局拨款４万元，按原造型改建为砖木结构。现由主玛寺管委会对其进行管理。