龟驼碑的故事起源于陈宣帝年间，当时北方为北周，北周武帝灭佛时，齐地海曲慧闻禅师被迫从海上南下，遇到大风浪，船沉海底。这时有一只神龟将慧闻等人驼到江宁（现在的南京）。慧闻向神龟道谢时，神龟说:"师父不认识我了，我就是海曲（今日照）石梁溪放生池里的老龟。这时慧闻才恍然大悟。原来慧闻在海曲曾买下石梁溪作为放生池。后来慧闻将这个故事讲给陈宣帝听，陈宣帝很感动，就下诏建报恩寺，并为此立碑。石碑由龟背负，既是对神龟报恩的诠释，也取其天长地久之意。

该故事见于唐代：

健康报恩寺

（唐 　慧仁）

慧闻者，齐渤海人也。幼年向佛，十二入寺，十六受戒。苦修《大智度论》、《中论》，树“一心三观”，启天台之源。所入法门，非世可知。学者仰之，以为履地戴天，莫知高厚。又以悯寺所得榇施，买海曲溪石梁为放生池，佛法广播于江北。

建德六年，齐地佛门遭劫。闻率僧众四十余循海路奔健康。辄遇大风波，楫折船沉。忽现巨龟，负众僧出水，须臾抵健康。闻口称南无阿弥陀佛。龟对曰：师父曾记否，吾乃海曲放生池之老龟也。闻恍然大悟。奏闻宣帝，帝大悦，敕建报恩寺，香火祀之。