护理学系开办于1998年，首招三年制大专，2000年经教育部批准转入五年制本科教育，培养中西医结合方向的高层次新型护理人才，是学院的一级学科，学生修完学分，达到学位标准，授予“医学学士”学位。

国际护理专家预言：21世纪护理学专业是最热门的专业。国际护士协会首席执行官也说：“在世界的每一区域，公众一致认为护士和护理是最受羡慕的职业。”我校有40多年的办学经验，有良好的办学基础及办学环境，附属医院曾统招了六届中医护士班、八期中医护理理论提高班、五期护理部主任学习班，护理师资、临床教学均有相当实力。护理学系开办以来，得到学院领导的关心、支持，重视师资队伍建设和实验室建设。教师经临床培训后，均送北京大学护理学院、北京中医药大学等高等学府进修；实验室设备及管理水平均达到较高层次，设有ICU实验室，为护理学系办学打下扎实基础。98级高护班顺利毕业，获省级、校级优秀班级，英语四级通过率在全校名列前茅，就业情况全校最好。她们的优秀表现，为护理学系办学迈出了可喜的步伐。

福建中医学院海外学院为护理学系开展国内外交流提供了良好的条件。目前护理学系除与国内护理界开展教学与学术交流外，还与芬兰、日本、丹麦开展教学与学术交流。芬兰、瑞典、丹麦、澳大利亚与我校签定联合办学协议，现已有6名我系学生在芬兰护理学院学习，丹麦国立大学护理学院毕业生到我系及附属医院实习，为护理学系办学拓宽了美好的前景。