肽单元（peptide unit），肽键中的4个原子及相邻的2个α-C原子重复形成的长链结构。

20世纪30年代末L.Pauling和R.B.Corey用X线衍射技术分析了氨基酸和寡肽的晶体结构，发现了肽键与周围相关原子的关系，提出了肽单元（peptide unit）的概念。他们发现构成肽键的C—N键长为0.133nm，比相邻的Cα—N单键（0.145nm）短，而较C=N双键（0.128nm）长，所以具有部分双键的性质，不能自由旋转，且围绕肽键C和N的三个键角之和均为360°，说明构成肽键的6个原子Cα1、C、O、N、H、Cα2同处在一个平面上，形成所谓的肽单元。