南极底层水（Antarctic bottom water）是南极海水深3000米之下低温高密度的底层流动水体。其终年温度约-0.5℃，盐度34.66‰，由于密度很大，一般沿深海底部流动，活动范围可达太平洋的北纬50°、大西洋的北纬45°地区。对大洋盆地的地球化学过程、沉积物分布和地貌形态特征的形成起重要作用，特别是对深海水团的充氧作用、生物和沉积物的氧化作用、底部沉积物的侵蚀和不整合的形成、沉积物的再沉积和特殊海底地形的塑造、碳酸盐和硅酸盐的溶解以及锰结核沉积场所的形成过程均起重要作用。地质时期的南极底层水可能形成于中新世中期（14百万年），在南极冰盖形成时,太平洋、大西洋和印度洋广大地区产生了中新世大规模的沉积间断。