词条 | 拷贝数 |
释义 | 定义copy number拷贝数就是指某基因(可以是质粒)在某一生物的基因组中的个数. 单拷贝就是该基因在该生物基因组中只有一个,多则指有多个。 (一)在细菌细胞中,某种特定质粒的数目。根据复制特性,质粒分严紧型和松弛型两类,前者在细胞中只含1~2个,而后者含10~15个以上。恒定的拷贝数与质粒复制控制系统、宿主细胞遗传背景及生长条件有关。质粒复制控制系统首先通过调节复制的起始点来控制拷贝数,调节因素包括阻遏蛋白、反义RNA和某些顺向重复序列。有些质粒还有其他控制系统,如有分配功能的par系统和确保质粒稳定遗传的ccd系统。一旦质粒上与调控有关的基因或位点突变,可使拷贝数明显增加或减少。 (二)在细菌细胞中,某种特定基因的数目。 检测方法一般检测方法有 1、southern blotSouthern blot 是一种常用的 DNA 定量的分子生物学方法。其原理是将待测的 DNA 样品固定在固相载体(硝酸纤维膜或尼龙膜)上,与标记的核酸探针进行杂交,在与探针有同源序列的固相 DNA 的位置上显示出杂交信号,通过检测信号的有无、强弱可以对样品定性、定量,从而计算出转入的拷贝数。 Southern 法准确性高、特异性强,但存在费时费力的缺点。另外,由于 Southern 法检测不经过靶片段的扩增( PCR ),一般每个电泳通道需要 10-30 μ g 的 DNA ,在实际操作中就需要较大量的植物材料来提取 DNA ,而转基因植物的愈伤组织在无菌条件下经过筛选、重新分化后一般都比较细弱,不宜大量取样。如果外源基因在插入时发生基因重组,造成限制性酶切位点丢失, Southern 法也无法检测到。这些因素都制约了 Southern 法在 T 0 代转基因植物中检测外源基因拷贝数的应用。 2、实时荧光定量PCR其定量的基本原理是在 PCR 反应体系中加入非特异性的荧光染料(如: SYBR GREEN I )或特异性的荧光探针(如: Taqman 探针),实时检测荧光量的变化,获得不同样品达到一定的荧光信号(阈值)时所需的循环次数: CT 值( Cycle Threshold );通过将已知浓度标准品的 CT 值与其浓度的对数绘制标准曲线,就可以准确定量样品的浓度。荧光定量 PCR 技术具有简便、快捷的优点,能够有效扩增低拷贝的靶片段 DNA ,对每克样品中 20pg-10ng 的转基因成分进行有效检测。同时,与 Southern 法相比,荧光定量 PCR 技术可对 T-DNA 的不同序列进行扩增,因此能实现对转基因品系中的基因重组的检测( Giovanna 2002 )。 |
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