截污导流工程是输水干线在输水期间防止沿线工业、城镇生活污废水（中水）排放而影响调水水质的控制性工程。

截污导流工程，将处理厂处理后的尾水分别导向回用处理设施、农业灌溉设施和择段排放设施，依靠各类污水资源化设施和流域综合整治工程，提高污水的资源化水平，使治污工程项目形成“治、截、导、用、整”一体化的治污工程体系，并通过实施清水廊道、用水保障和水质改善三大工程措施，来保证干线的输水水质。