候选基因(candidate gene)，也译成后选基因，定位于染色体部位，这一类基因在疾病中表达情况尚不明确，其蛋白产物也正在探讨中。它们参与生物体的表型表达，连锁分析提示其与基因组某一部位有关联。这些基因可能是结构基因,调节基因或是在生化代谢途径中影响性状表达的基因。