给水消毒是城市给水处理系统中杀灭对人体有害的病原微生物的给水处理过程。城市给水系统中，地面水源的给水处理厂（地下水源来水一般经过简单沉淀处理后或直接进行消毒处理）中水经混凝沉淀、过滤以后，能除去很多细菌。一般说，混凝沉淀可去除水中的大肠菌50-90%，过滤可以进一步去除水中的大肠杆菌90%左右，但远远达不到饮用水水质标准中规定的要求（饮用水消毒合格指标为1升水中的大肠杆菌数少于3个）。这时水中往往还含有大肠菌100个左右，因此，还需进行最后的消毒处理。给水消毒的方法很多，常采用的有氯消毒、臭氧消毒、紫外线消毒等。其中氯消毒法由于价格低廉，效果好应用最广。但因其在水中可产生致癌有机氯化物且对病毒、孢囊的杀灭能力较差，近来外国多采用臭氧法消毒。