植物繁育系统是当今进化生物学研究中最为活跃的领域。通过对植物繁殖系统的研究可以为进化学、行为学、系统发育学开辟一条独特的研究途径。繁育系统是指代表所有影响后代遗传特性组成的有性特征的总和，主要包括有花形态特征、开花、传粉、受精、种子发育机制、花器官各部位的寿命、传粉者种类和频率、自交亲和程度以及交配系统等。植物繁育系统是以“生殖”为核心，把植物与环境的相互作用及相互适应有机地结合起来，以探讨物种多样性发生历史、维持机理和保护策略为最终目的的综合交叉性学科。从广义上说，植物的繁育系统包括了植物对下一代个体有关性表达的所有特征；从狭义上讲，指控制居群或分类群中异交或自交相对频率的各种生理和形态机制。

目前，对植物繁育系统的研究主要分为两个层次：第一层次是研究自交与异交所产生子代的相对比例，即自交率与异交率；第二层次是研究基因流的过程与式样。对于雌雄同花的植物，有一些植物可以自交完全亲和，而另一些则自交不亲和。在自交亲和的植物中，有一些具有促进接受外来花粉的机制，而另一些则具有阻止接受外来花粉的机制。有关基因流的研究主要集中在等位酶、遗传标记、微卫星手段等方面。