中国科学院院士工作局是学部主席团和各学部常委会的秘书和参谋机构，是在院党组的领导下，实现学部作为国家科学思想库作用的办事机构。负责组织院士根据我国国民经济、社会发展和科学技术进步的需求，开展调研、评议、咨询和学术交流活动；负责组织院士、外籍院士的增选；负责组织全体院士大会、各学部常委会及其院士会议、学部主席团及其执行委员会议；根据院党组和学部各级领导机构的决定，制订学部工作计划并组织实施；负责对院士的联络、服务及有关问题的调研、通报工作；作为陈嘉庚基金会秘书处，组织陈嘉庚科学奖的评奖颁奖工作；作为蔡冠深基金会秘书处，组织蔡冠深中国科学院院士荣誉奖金的发放等工作。