遗传系谱法的最早科学依据来自于孟德尔的豌豆实验——基因遗传。该实验奠定了近代遗传的研究方法，同时也促成了许多关于基因遗传的定律，包括遗传病的防控措施。通过遗传系谱法，可以对生物（主要为植物）进行有利基因的选择和不利基因的剔除，可将有利基因得到保留，从而得到高效、稳定的植株。该法有点为：效果迅速，效果明显，有利基因单一选择性强。如只需剔除个别不利基因或保留有益基因，其成本十分低廉。但如果需要对多个基因进行调整，尤其对非单一染色体基因的调整，则需要选择大量的植株，费用高，需要年限长，且不利基因难以保证剔除率。