市“十一五”规划把杨浦知识创新区纳入上海的创新基地之一。2007年2月，杨浦知识创新基地获市政府有关部门正式批准，重点发展与创意产业、环保节能、新材料、光机电一体化有关研发及其他相关产业。2008年8月，市政府批复同意杨浦知识创新基地规划范围从2.2平方公里扩大到9.46平方公里，并被纳入张江开发体制和政策扶持范围，2009年，杨浦知识创新基地共有18个项目获得1.1亿元张江专项资金资助。